使用 Maya 製作大型的專案時，通常需要牽涉各種不同類型的檔案，如未採用系統化的管理方式，專案作業可能遇到執行困難的問題。注意 Maya 儲存檔案與資料夾的名稱限制，檔名必須是英文開頭並可使用數字，不可包含中文或是底線 _ 以外的特殊符號。
建立專案資料夾
執行 [ File > Set Project... ] 開啟設定專案視窗並選擇專案資料夾，若未建立資料夾可按下視窗右上方的 Create New Folder 按鈕。
新建立的資料夾應該未包含 Maya 的專案定義檔，請按下 Create default workspace 按鈕。
點選功能表 [ File > Project Window ] 開啟 對話框，資料夾可讓您放置不同類型的檔案，例如貼圖的紋理檔案可放在 Sourceimage 資料夾，稍後設定材質時會自動到此資料夾瀏覽，Maya 允許您自訂資料夾名稱。
專案資料夾已經建立。
建立新場景
執行 [ File > New Scene ] 建立新的場景，若點選 New Scene 旁的 
圖示可同時設定單位、播放速度、影片播放長度等。
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Default Working Units 單位設定 Linear 單位：可選擇 millimeter 公厘、centermeter 公分、meter 公尺、inch 英吋等單位。 Angular 角度：可選擇 degrees 角度、radians 弧度為單位。 Time 播放速度：預設值為 24 fps（電影的播放速度每秒 24 影格），若使用 Maya 製作電視播放的影片，請選擇 NTSC ( 30 fps )。 Default ViewCube Settings 檢視方塊設定 Show the Compass below the ViewCube 勾選後顯示羅盤。 Default Time Slider Settings 時間滑桿設定 Playback start / end。 Animation start / end。 |
Maya 部份工具或指令右側的 圖示，稱為 Option box，點選時可開啟選項對話框設定相關的參數，例如建立方塊時，透過 Option box 可以準確地設定長度、寬度與高度。
檔案的相容性
Maya 開啟檔案時可向下相容，使用舊版 Maya 儲存的檔案可在較新版的 Maya 開啟，相反的使用舊版 Maya 開啟新版本 Maya 儲存的檔案時可能會有問題，以下是使用 Maya 2009 開啟 Maya 2012 檔案時出現的錯誤訊息。
錯誤回報
若遇到無法繼續執行的情況 Maya 將嘗試自動儲存並顯示錯誤訊息，為了避免遇到當機影響工作進度，建議養成隨時存檔的習慣。
